More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4996 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  100 
 
 
289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  92.73 
 
 
289 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  83.39 
 
 
289 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  70.93 
 
 
289 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  67.47 
 
 
288 aa  407  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  68.06 
 
 
295 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  67.47 
 
 
288 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  67.47 
 
 
288 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  67.82 
 
 
295 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  66.09 
 
 
288 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  65.65 
 
 
293 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0597  AraC family transcriptional regulator  45.14 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  68.1 
 
 
152 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4021  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
288 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185045  normal  0.0217611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 
300 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 
313 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00257  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.74 
 
 
283 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3321  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 
283 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0352  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
285 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0313  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
285 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0332  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 
285 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1897  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0436968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2009  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 
297 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1794  putative regulatory protein  28.57 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227844  normal  0.117823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1796  putative regulatory protein  28.22 
 
 
283 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.259376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1480  putative regulatory protein  28.22 
 
 
283 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03934  DNA-binding transcriptional dual regulator  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0326041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3930  transcriptional regulator, AraC family  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4580  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3965  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.105984 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03894  hypothetical protein  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0334168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4304  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4615  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5565  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  55.77 
 
 
107 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601347  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1661  putative regulatory protein  28.22 
 
 
283 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0701683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  53.85 
 
 
107 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  53.85 
 
 
107 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  53.85 
 
 
107 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  53.85 
 
 
107 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  53.85 
 
 
107 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0268  putative HTH-type transcriptional regulator YkgA  38.62 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00261  hypothetical protein  36.6 
 
 
219 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  52.88 
 
 
108 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3303  transcriptional regulator, AraC family  36.6 
 
 
228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  48.57 
 
 
118 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
140 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1997  DNA-binding transcriptional activator MarA  50 
 
 
127 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01490  DNA-binding transcriptional dual activator of multiple antibiotic resistance  50.5 
 
 
127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2115  transcriptional regulator, AraC family  50.5 
 
 
127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1733  DNA-binding transcriptional activator MarA  50.5 
 
 
127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1691  DNA-binding transcriptional activator MarA  45 
 
 
127 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1674  DNA-binding transcriptional activator MarA  50.5 
 
 
127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1816  DNA-binding transcriptional activator MarA  45 
 
 
127 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1632  DNA-binding transcriptional activator MarA  45 
 
 
127 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2127  DNA-binding transcriptional activator MarA  50.5 
 
 
127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.299134  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1639  DNA-binding transcriptional activator MarA  50.5 
 
 
127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1624  DNA-binding transcriptional activator MarA  45 
 
 
127 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.936948  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2145  DNA-binding transcriptional activator MarA  50.5 
 
 
127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01501  hypothetical protein  50.5 
 
 
127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1651  DNA-binding transcriptional activator MarA  45 
 
 
127 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00571718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  46.23 
 
 
120 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  46.15 
 
 
113 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  46.15 
 
 
113 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  46.15 
 
 
113 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 
279 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  45.19 
 
 
113 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  45.19 
 
 
113 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  45.19 
 
 
113 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 
279 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0027  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 
128 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 
128 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  33.33 
 
 
279 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 
129 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
128 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
221 aa  89  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  25.59 
 
 
298 aa  89  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  30.64 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  26.64 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>