More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1613 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1613  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  621  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0246689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 686 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 686 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  26.45 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0396  AraC-like transcriptional regulator  24.48 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000261695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  24.2 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3846  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  24.8 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  24.27 
 
 		 745 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  24.27 
 
 		 745 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  23.69 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  26.54 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1148  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00767065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  25.46 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  21.97 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4615  helix-turn-helix domain-containing protein  27.39 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00567057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2883  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000839866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 436 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  25.81 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 766 aa  59.7  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  22.9 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 543 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 791 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  39.24 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  23.16 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26.98 
 
 		 1374 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  27.01 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  29.69 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  22.63 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  23.95 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1294  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0435473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  30.3 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 793 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4396  DNA-binding response regulator  33 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4237  DNA-binding response regulator  33 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4249  DNA-binding response regulator  33 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4736  DNA-binding response regulator  33 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  31.93 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  26.7 
 
 		 530 aa  56.6  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4614  DNA-binding response regulator  33 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2338  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  35.35 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  25 
 
 		 537 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  31.63 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.37 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  30.68 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>