More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4615 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4615  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00567057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  48.19 
 
 		 285 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5635  transcriptional regulator, AraC family  48.18 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  0.936217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3850  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.24 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.427371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2509  transcriptional regulator, AraC family  41.22 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4858  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00250208  normal  0.0726035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  33.8 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  34.64 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4328  transcriptional regulator, AraC family  34.03 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0187  cupin 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.778643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10188  transcription regulator  32.11 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2143  transcriptional regulator, AraC family  28.41 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4681  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399866  hitchhiker  0.000374446 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6122  transcriptional regulator AraC family  24.3 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2717  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0275  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  22.61 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0388  transcriptional regulator, AraC family  20.24 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75747  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2198  AraC family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.983823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  23.53 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2789  transcriptional regulator, AraC family  22.14 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3777  transcriptional regulator, AraC family  23.55 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1456  transcriptional regulator, AraC family  23.9 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.724936  normal  0.408228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  23.14 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  23.14 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6236  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3253  AraC family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5975  transcriptional regulator, AraC family  24.71 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  23.95 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0580  transcriptional regulator, AraC family  20.63 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  22.05 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2506  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.108721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2791  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  21.01 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  28.3 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  22.43 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4332  transcriptional activator RhaR  23.77 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0206667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4291  transcriptional activator RhaS  28.7 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  28.7 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0197402 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4377  transcriptional activator RhaS  28.7 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4443  transcriptional activator RhaS  28.7 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4263  transcriptional activator RhaR  23.62 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4378  transcriptional activator RhaR  23.4 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 359 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4292  transcriptional activator RhaR  23.77 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  20.85 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  21.09 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1416  AraC family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  23.83 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1908  transcriptional regulator PobR  21.74 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2197  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4262  transcriptional activator RhaS  28.7 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3787  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0471905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.12 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1434  transcriptional regulator, AraC family  22.91 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 1201 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03791  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  26.42 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5358  transcriptional activator RhaS  26.42 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4079  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  24.05 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4112  transcriptional activator RhaS  26.42 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4444  transcriptional activator RhaR  22.88 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2534  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  26.42 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  21.72 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03740  hypothetical protein  26.42 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02292  predicted DNA-binding protein  25.83 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4297  transcriptional activator RhaS  26.42 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082999 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02253  hypothetical protein  25.83 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1287  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>