More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1597 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  627  1e-179  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 686 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 686 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  37.69 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  27.86 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  32.84 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  32.09 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  39.45 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 548 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 1201 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 517 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 515 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 162 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1856  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 793 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.1682  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  34.68 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  38.78 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.4 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2883  transcriptional regulator, AraC family  23.62 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000839866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  29.1 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  29.1 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0187  cupin 2 domain-containing protein  25.29 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.778643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 530 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  27.87 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 535 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  31.07 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6111  transcriptional regulator, AraC family  22.81 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 150 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 250 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 150 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  30.37 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 150 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  35 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0396  AraC-like transcriptional regulator  24.9 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000261695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  23.86 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.22 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  23.11 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  26.15 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  35 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  23.85 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>