78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1601 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
361 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  99.72 
 
 
361 aa  745    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  97.78 
 
 
361 aa  729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  97.23 
 
 
361 aa  727    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  96.91 
 
 
356 aa  715    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  99.61 
 
 
255 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  50.42 
 
 
370 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 
350 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.9 
 
 
364 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  91.06 
 
 
134 aa  232  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 
374 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  38.42 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  39.3 
 
 
348 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  39.3 
 
 
348 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  38.89 
 
 
379 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  37.33 
 
 
376 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  38.02 
 
 
368 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.92 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  38.27 
 
 
370 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  37.46 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  38 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 
345 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  39.23 
 
 
345 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  34.97 
 
 
342 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  34.97 
 
 
342 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  38.89 
 
 
348 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  38.44 
 
 
353 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  35.4 
 
 
345 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  37.46 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  33.14 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  36.5 
 
 
347 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  38.22 
 
 
348 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  36.81 
 
 
347 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  37.77 
 
 
353 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  37.79 
 
 
348 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  35.58 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  35.58 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  35.71 
 
 
348 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.89 
 
 
377 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  37.28 
 
 
349 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  34.76 
 
 
364 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  36.31 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  36.75 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  33.76 
 
 
353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  35.66 
 
 
283 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.08 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  33.24 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.12 
 
 
363 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  33.23 
 
 
331 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  31.99 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  31.86 
 
 
367 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  33.65 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  32.3 
 
 
344 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 
351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  33.01 
 
 
330 aa  143  6e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  30.1 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  31.73 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 
343 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  30.62 
 
 
351 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  30.48 
 
 
349 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  29.53 
 
 
351 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  31.39 
 
 
178 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
181 aa  64.3  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  24.86 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  29.67 
 
 
159 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  26.71 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  30.63 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  24.45 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  29.33 
 
 
368 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 
104 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
108 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  29.47 
 
 
151 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  28.21 
 
 
130 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 
153 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>