32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2100 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  100 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.71 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.18498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0205  cupin 2 domain-containing protein  53.7 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1726  cupin 2 domain-containing protein  48.89 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334039  normal  0.571645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3324  cupin 2 domain-containing protein  43.36 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3841  cupin 2 domain-containing protein  50.55 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2136  hypothetical protein  44.25 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1115  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.378995 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.88 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5217  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181963  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 123 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 181 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  36.92 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  36.25 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 292 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  34.38 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  35.56 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 187 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>