38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1386 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.48 
 
 		 116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  54.31 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  38.53 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  43.62 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  42.7 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.2 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  22.52 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  29.9 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  25.71 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.32 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  20.91 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0615  hypothetical protein  40.26 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.32 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  33.71 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  34.21 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  28.92 
 
 		 551 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.44 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1663  DNA-binding protein  30 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  31.88 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  32.94 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  33.85 
 
 		 671 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  32.39 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>