109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0950 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  332  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  77.86 
 
 		 152 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  70.27 
 
 		 154 aa  233  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.25 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.99 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.99 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  42.99 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  42.99 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.83 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  38.68 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  31.72 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  38.1 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  32.69 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.19 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  34.82 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  33.93 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  35.35 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.41 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  26.98 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  35.58 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  34.26 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  33.91 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  30.37 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  32.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  32.41 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  32.67 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  28.85 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  26.81 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  35.51 
 
 		 332 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  30.51 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  24.07 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.58 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  25.55 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  35.85 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  34.23 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  35.51 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.93 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  35.51 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.09 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  31.09 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.82 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  29.5 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  29.5 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  31.03 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  31.03 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  30.69 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  31.03 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  23.94 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  32.08 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  28.69 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  32.77 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  32.77 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  32.77 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  31.9 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  24.09 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  25.19 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  32.52 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  23.94 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 		 172 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.01 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  26.6 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  24.42 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.15 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.74 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  21.32 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.19 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.29 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  21.05 
 
 		 172 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  30.11 
 
 		 671 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  30.48 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  29.63 
 
 		 113 aa  41.6  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.35 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  30.48 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  30.48 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  30.48 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>