120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1644 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 154 aa  320  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  51.63 
 
 		 152 aa  173  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  40.48 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  39.68 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  37.6 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  34.59 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  36.63 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.9 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  30.37 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.61 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  37.62 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  34.91 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  30.22 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.62 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  30.97 
 
 		 190 aa  70.5  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.34 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.48 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.48 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  31.48 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  31.48 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  29.91 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.9 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  27.12 
 
 		 332 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.64 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  32.67 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  32.65 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.72 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  29.63 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  30.7 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.33 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  25.33 
 
 		 372 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  30.33 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.33 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  34.12 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  29.01 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.42 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  35.29 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  31.96 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  30.43 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  26.74 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  31.52 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  29.69 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  32.61 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  26.36 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  27.86 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  27.83 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.83 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  28.7 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.88 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  25.21 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  25.6 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 115 aa  51.2  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.15 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.6 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  27.83 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  25.86 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.96 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.2 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  28.28 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  34.78 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  32.35 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  25.47 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3325  mannose-6-phosphate isomerase, type II  29.69 
 
 		 448 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.321079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  30.99 
 
 		 116 aa  43.9  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  34.85 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>