93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3249 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  343  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.03 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.17 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.83 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  31.58 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.68 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  34.43 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  32.17 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  30.61 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  31.5 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  35.92 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.35 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.33 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  32.09 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.75 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.9 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  28.93 
 
 		 332 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  30.63 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  35.11 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  31.07 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  32.52 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  26.92 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 372 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  31.73 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  27.64 
 
 		 333 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.12 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  27.12 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.12 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  27.12 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.37 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 163 aa  47.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.37 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  30.38 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.32 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  28.42 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  31.4 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  28.04 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  31.4 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  28.7 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  32.43 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  30.3 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  35.21 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  39.06 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  35.21 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  27.1 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  35.21 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  35.21 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  35.21 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  35.21 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  35.21 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3399  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 108 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 156 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 125 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 159 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  26.88 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  26.45 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  37.5 
 
 		 120 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  26 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  29.47 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  29.47 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  29.47 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>