52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3626 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
159 aa  320  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  33.12 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  38.1 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.78 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  32.9 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.56 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.2 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.79 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  35.07 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  34.13 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  31.47 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  34.12 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.42 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  34.88 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.48 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  34.38 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  32 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.63 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  35.71 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  30.63 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.63 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  42.03 
 
 
333 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 
190 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  33.65 
 
 
332 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.58 
 
 
332 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  27.08 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.51 
 
 
160 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  27.55 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  27.1 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  27.1 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  24.35 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>