88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3161 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
158 aa  328  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.82 
 
 
166 aa  227  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.51 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.99 
 
 
172 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  45.99 
 
 
171 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.99 
 
 
172 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.59 
 
 
171 aa  136  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  44.44 
 
 
173 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.96 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  38.06 
 
 
174 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  36.29 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  38.28 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  32.58 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  34.9 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  32.58 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  36.36 
 
 
172 aa  84  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  38.21 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  33.98 
 
 
166 aa  77  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.79 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  32.84 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  34.95 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  34.95 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  35.35 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  37.62 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  33.59 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  32.59 
 
 
332 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.42 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  35.29 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  34.23 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  32.43 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  33.88 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  32.43 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  31.09 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 
190 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  24.55 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  28.12 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  27.93 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.41 
 
 
332 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  28.92 
 
 
372 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
333 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.74 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  31.68 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.74 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  26.47 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  28.74 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  28.71 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.66 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  29 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  26.47 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  29.13 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  38.2 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  32.04 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36928  predicted protein  25.42 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  23.85 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  24.81 
 
 
160 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  24.81 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  24.81 
 
 
160 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  24.81 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  39.34 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  26.13 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  26.13 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.46 
 
 
399 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18080  cupin domain-containing protein  37.14 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.259998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>