38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0118 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.16 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1227  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.74 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.718162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.85 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.66 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1941  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.2 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.65 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.43 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.09 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3399  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.19 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0993082  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3034  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.24 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  36.99 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 166 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2443  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 		 450 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2852  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.49 
 
 		 476 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.36 
 
 		 332 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  36.36 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0541  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.89 
 
 		 474 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  36.99 
 
 		 332 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0538  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.89 
 
 		 474 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 152 aa  40  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>