109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0865 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  322  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  75 
 
 		 158 aa  254  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  71.43 
 
 		 154 aa  234  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.28 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.45 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  35.58 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  27.34 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  35.92 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  39.81 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  35.92 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.56 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  35.51 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  35.71 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.06 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.08 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  37.65 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  28.12 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  37.65 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  37.62 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  37.65 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.78 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  35.92 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  36.45 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  33.65 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  28.95 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  32.73 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  29.32 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  33.03 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.61 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  34.62 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  29.69 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  33.62 
 
 		 332 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  33.66 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  30.7 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  30.56 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.45 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  34.62 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  34 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  34.62 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  34.62 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  34.62 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.45 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  33.61 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  27.01 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  33.61 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  35.58 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  34.58 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.36 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  34.65 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  32.69 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  26.28 
 
 		 372 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  26.45 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  31.58 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  23.48 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  23.85 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  43.66 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.63 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.75 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.43 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  42.25 
 
 		 115 aa  44.3  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  35.37 
 
 		 120 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  26.13 
 
 		 350 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>