15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0589 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 162 aa  331  3e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0993082  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1941  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.21 
 
 		 166 aa  201  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.75 
 
 		 161 aa  191  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.8 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3399  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.61 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1346  hypothetical protein  33.97 
 
 		 208 aa  87.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.956224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.43 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1227  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 124 aa  48.5  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.718162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.2 
 
 		 114 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 125 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.07 
 
 		 135 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  36.71 
 
 		 172 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>