30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3525 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 136 aa  283  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.69 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1227  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.718162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.7 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  24.75 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  39.29 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  26.88 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  29.81 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 182 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  25.32 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.74 
 
 		 130 aa  40  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>