93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0304 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
156 aa  323  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  55.56 
 
 
161 aa  175  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  54.49 
 
 
160 aa  174  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  54.25 
 
 
161 aa  170  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  50.32 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.65 
 
 
160 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  53.29 
 
 
157 aa  158  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  59.06 
 
 
129 aa  154  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  52.26 
 
 
159 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  48.32 
 
 
157 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.68 
 
 
159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.75 
 
 
159 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  47.02 
 
 
159 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  51.43 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  45.27 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  39.49 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  39.42 
 
 
153 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.41 
 
 
152 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  44.29 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  41.58 
 
 
152 aa  84.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  36.24 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  38.83 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  34 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  34 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  42.72 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  41.75 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  39.81 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  32.03 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  42.72 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  42.72 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  31.93 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  40.78 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  42.72 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  35 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  41.75 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  33.88 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  31.43 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  40.78 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  37.86 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  37.86 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  37.86 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  37.86 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  37.86 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  37.86 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  28.69 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 
170 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  27.34 
 
 
159 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  34.31 
 
 
171 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.96 
 
 
332 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.37 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  30.3 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  27.56 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  28.17 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 
333 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  28.28 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  31.91 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  35.11 
 
 
332 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  26.73 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  27.47 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  26.36 
 
 
372 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  26.37 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 
174 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
276 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 
166 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.74 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0251  hypothetical protein  35.85 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319828  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.77 
 
 
179 aa  40.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 
136 aa  40.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>