79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2936 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  100 
 
 
151 aa  306  9e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  51.59 
 
 
152 aa  130  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  45.95 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.86 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  38.14 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.72 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  34.82 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  40.95 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  40.95 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  40.95 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  36.94 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  36.97 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  37.11 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  37.14 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  33.05 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  39.78 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  35.09 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  35.24 
 
 
160 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  35.24 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  35.24 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  35.24 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  33.33 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  35.24 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  35.24 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  29.25 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  36.73 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  39.58 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  32.08 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  36.96 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  36.73 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.45 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  36.96 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  36.96 
 
 
160 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  35.42 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  36.44 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.19 
 
 
172 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  30.7 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.6 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  29.84 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.84 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  29.84 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.84 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.68 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  34.12 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  27.72 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  24.82 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  25.23 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  25.47 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  37.37 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 
332 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.42 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 
333 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  31.48 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  28.8 
 
 
163 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  37.14 
 
 
389 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  31.96 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>