88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0887 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  316  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  99.35 
 
 
160 aa  315  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  98.69 
 
 
160 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  98.69 
 
 
153 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  98.69 
 
 
153 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  98.04 
 
 
160 aa  309  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  68.03 
 
 
155 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  68.03 
 
 
155 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  68.71 
 
 
172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  65.99 
 
 
155 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  64.63 
 
 
155 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  64.63 
 
 
155 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  64.63 
 
 
155 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  59.86 
 
 
154 aa  187  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  47.45 
 
 
170 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  46.21 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  45.45 
 
 
167 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  43.18 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.18 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.18 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  43.18 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  32.59 
 
 
190 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  35.92 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.1 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.1 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  38.61 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  36.27 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.86 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  34.91 
 
 
332 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  33.87 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  37.78 
 
 
333 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  30.39 
 
 
172 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  39.42 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 
172 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  35.24 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  35.42 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  32.69 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  30.63 
 
 
162 aa  58.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  33.98 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.58 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  33.65 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  33.66 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.05 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  30.88 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.04 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  36.9 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 
167 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.04 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  31.68 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  31.37 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  28.89 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  32.98 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  34.58 
 
 
173 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  32.35 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 
311 aa  47  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.48 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  35.45 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  32.69 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  34.91 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  31.86 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  48.28 
 
 
114 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  31.15 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  36.23 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 
259 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
662 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.13 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
281 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 
259 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 
259 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 
286 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>