78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2501 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  337  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  96.27 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  59.48 
 
 
160 aa  197  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  60.67 
 
 
157 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  55.92 
 
 
159 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.17 
 
 
160 aa  179  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  55.26 
 
 
159 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.26 
 
 
159 aa  177  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.26 
 
 
159 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.56 
 
 
156 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  51.66 
 
 
157 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  58.14 
 
 
129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  52.23 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  47.62 
 
 
155 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  38.41 
 
 
153 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.75 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  37.24 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  39.86 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.05 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  33.05 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.05 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  33.05 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  36.63 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.7 
 
 
332 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  29.37 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  30.56 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 
190 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  35.64 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  35.64 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  35.64 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  34.65 
 
 
155 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  34.95 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 
333 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  27.59 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  37.25 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  37.25 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  34.65 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  36.73 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  33.66 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  33.66 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  33.66 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  33.66 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  30.61 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  33.66 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  33.66 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  33.98 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  27.78 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  25.93 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  34.18 
 
 
332 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.97 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 
166 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  28.57 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  24.56 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0207  hypothetical protein  35.21 
 
 
95 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 
372 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  27.83 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3880  cupin 2, barrel  28.43 
 
 
163 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434972  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 
172 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>