100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1696 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  100 
 
 
161 aa  323  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  54.43 
 
 
170 aa  191  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  51.25 
 
 
167 aa  177  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  53.57 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.57 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.86 
 
 
161 aa  161  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  52.86 
 
 
161 aa  161  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  53.79 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  53.79 
 
 
155 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  53.79 
 
 
155 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  53.79 
 
 
155 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  53.79 
 
 
155 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  52.27 
 
 
155 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  52.27 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  51.82 
 
 
154 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  47.06 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  47.06 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  46.97 
 
 
153 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  46.97 
 
 
153 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  46.32 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  46.21 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  39.01 
 
 
170 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  33.83 
 
 
190 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.21 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  36.3 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  32.85 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.81 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  36.15 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.81 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  34.92 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  39.45 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.03 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.37 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  36.45 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  32.06 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  31.82 
 
 
332 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.06 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  30.25 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  31.48 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  31.13 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  32.41 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  30.56 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  32.71 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  35.71 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  32.71 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  32.71 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  32 
 
 
171 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  33.03 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 
172 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  31.5 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.76 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  32.65 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  32 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  30.88 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  33.65 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  30.84 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  39.36 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  34.02 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  33.66 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  30.7 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  28.97 
 
 
249 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  31.96 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  33.71 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  36.56 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  32.95 
 
 
405 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  41.38 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1146  DNA-binding protein  27.1 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112687  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0768  DNA-binding protein  27.1 
 
 
242 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1221  DNA-binding protein  27.1 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1732  DNA-binding protein  27.1 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2423  DNA-binding protein  27.1 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0698  DNA-binding protein  27.1 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 
115 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
150 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  34.78 
 
 
389 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 
103 aa  41.6  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  35.62 
 
 
234 aa  41.2  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.2 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.25 
 
 
138 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>