89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4979 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4979  cupin region  100 
 
 		 155 aa  321  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  54.9 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  53.95 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.97 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.7 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  51.01 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  54.96 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  50.35 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  50.34 
 
 		 159 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.1 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.1 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  46.45 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  46.41 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  49.32 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  47.62 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  47.62 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.27 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  46.41 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  41.86 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  37.25 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  39.55 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  36.94 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  35.24 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.24 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  33.66 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  32.48 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  33.62 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  35.85 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  33.65 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  33.96 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.69 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.55 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  33.02 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.67 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  31.09 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  34.95 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  33.6 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  26.55 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  26.55 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  26.55 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  29.03 
 
 		 332 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  35.45 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  35.45 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  35.45 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  35.45 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  35.45 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  35.45 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  28.46 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  25.89 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 166 aa  43.9  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  30.91 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.08 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  31 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1941  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 372 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.88 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  32.22 
 
 		 418 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  32.22 
 
 		 418 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  32.22 
 
 		 418 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  32.22 
 
 		 418 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  32.22 
 
 		 418 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  32.22 
 
 		 418 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  32.22 
 
 		 418 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  28.57 
 
 		 405 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  32.56 
 
 		 121 aa  40.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>