58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2020 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  100 
 
 		 155 aa  320  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.68 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  48.03 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  46.1 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  47.02 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  37.25 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.41 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  35.57 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  33.56 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  39.64 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  30.92 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  30.41 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  33.59 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  39.78 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  26.6 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  29.81 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  35.8 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  25.53 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 333 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  26.74 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  27.55 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  29.89 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.88 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.7 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 332 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  33.72 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  27.5 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 158 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 152 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  31.82 
 
 		 332 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  26.44 
 
 		 171 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  25.51 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.85 
 
 		 132 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>