75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0904 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  330  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  93.75 
 
 
160 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  93.75 
 
 
160 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  93.75 
 
 
160 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0251  hypothetical protein  60.98 
 
 
85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319828  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.4 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.62 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  36.56 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  32.74 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.62 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  39.76 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  27.19 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  31.71 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  31.65 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  31.71 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  32.37 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  31.68 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.14 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.14 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  30.94 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.82 
 
 
332 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  29.73 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  30.84 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 
172 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 
159 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  30.94 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  30.88 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  30.88 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  30.88 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  30.88 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  36.47 
 
 
332 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  30.61 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.36 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  30.88 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  30.88 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  36.96 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  32.43 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  33.67 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  29.59 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  29.79 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  32.61 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  29.89 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 
190 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  29.03 
 
 
157 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 
172 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  28.41 
 
 
172 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 
333 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  29.91 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  25.89 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  24.62 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  24.71 
 
 
119 aa  44.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  29.41 
 
 
171 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  24.44 
 
 
167 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  26.39 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  37.93 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
148 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3525  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  40.38 
 
 
126 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>