60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2188 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  82.73 
 
 		 111 aa  193  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.39 
 
 		 121 aa  191  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  74.78 
 
 		 121 aa  184  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  66.67 
 
 		 111 aa  155  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  54.63 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  57.55 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.27 
 
 		 111 aa  128  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  59.43 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  52.78 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  50.45 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  51.4 
 
 		 110 aa  120  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.51 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  52.43 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  52.88 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.6 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.6 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  50.98 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.48 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  49.5 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.52 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  40.87 
 
 		 117 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.3 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.92 
 
 		 115 aa  91.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  37.25 
 
 		 214 aa  90.1  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 219 aa  87  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.21 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  36.46 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  37.23 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  39.6 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  43.37 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.21 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  33.63 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  34.09 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  26.21 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  33.33 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  26.03 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.5 
 
 		 389 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  40.38 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  38.46 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  25.27 
 
 		 106 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  28.57 
 
 		 111 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 188 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>