78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0854 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  55.77 
 
 		 105 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  60.2 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  55.66 
 
 		 110 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  54.72 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  58.16 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.18 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.18 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  54.81 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.38 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  51.46 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  52.48 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  52.83 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  52.38 
 
 		 111 aa  123  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  51.43 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  49.53 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.46 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  50 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.7 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  48.08 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.51 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  44.23 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  50.54 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.51 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.59 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.41 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.59 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  42 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.16 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  49.4 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  39.6 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  35.64 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  33.67 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.36 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  32.41 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  32.58 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  27.27 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  31.82 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  32.31 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  42.59 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  39.29 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  28.57 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  32.39 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  29.87 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  29.87 
 
 		 312 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  33.8 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  25.84 
 
 		 123 aa  43.5  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  33.8 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  33.8 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  28.89 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  31.08 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.25 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  29.03 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.37 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  26.56 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  35.56 
 
 		 372 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  32.86 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.67 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 274 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.42 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  30.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  27.69 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>