24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19880 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  240  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 120 aa  52  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  29.59 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  32.94 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  29.27 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  33.8 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3944  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0892017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  25.84 
 
 		 107 aa  43.5  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  26.26 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  36.23 
 
 		 312 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 111 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 106 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  28.74 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  36.23 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  27.06 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  28.75 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>