71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0538 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  100 
 
 		 111 aa  228  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  64.86 
 
 		 111 aa  158  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  66.67 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.39 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  61.68 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.45 
 
 		 111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  56.36 
 
 		 111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  58.56 
 
 		 111 aa  134  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  52.88 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  49.51 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  53.68 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  47.22 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  44.86 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  46.36 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.5 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.5 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  46.23 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.55 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  44.23 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  47 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.74 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  45.92 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.73 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.45 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 219 aa  91.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  38.38 
 
 		 214 aa  91.3  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  41 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  46.99 
 
 		 87 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.28 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.05 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  36.08 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  41.84 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  38.37 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  35.35 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  35.42 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  32.95 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  39.71 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  31.03 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.51 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0857  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  29.27 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  31.43 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  30.93 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  31.15 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  37.68 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  31.43 
 
 		 312 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  31.75 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  25.53 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  26.15 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.2 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 		 389 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 503 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>