40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0950 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 389 aa  802    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.25 
 
 		 377 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  27.6 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  22.76 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06772  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.93 
 
 		 166 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  30.56 
 
 		 190 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.7 
 
 		 163 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.78 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.78 
 
 		 204 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  39.73 
 
 		 169 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.03 
 
 		 159 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  26.55 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.87 
 
 		 135 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  32.18 
 
 		 166 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 159 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.82 
 
 		 161 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  34.26 
 
 		 158 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  26.5 
 
 		 155 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 158 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.43 
 
 		 153 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  35.63 
 
 		 179 aa  46.2  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 165 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.47 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  28.72 
 
 		 163 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0025  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.33 
 
 		 97 aa  44.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2346  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 100 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  40 
 
 		 165 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 163 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 165 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  30.14 
 
 		 157 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 165 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  31.52 
 
 		 214 aa  43.5  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  26.5 
 
 		 126 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1710  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 121 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>