88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5299 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.83 
 
 		 159 aa  191  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.14 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  45.81 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  45.16 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  45.16 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  45.16 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  44.52 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.74 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  37.21 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.11 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  34.43 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  33.06 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.1 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  34.43 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  37.08 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.48 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  30.58 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.37 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  28.93 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.86 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  32.74 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  32.77 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  34.57 
 
 		 355 aa  51.2  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 204 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 389 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  34.43 
 
 		 114 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  27.78 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0400  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  30.68 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.78 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  29.55 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.09 
 
 		 356 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  36.07 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.26 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.84 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  34.26 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  27.42 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.46 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  28.75 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  28.75 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  28.75 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  28.75 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  28.75 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  28.75 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  28.75 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 124 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  28.75 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  28.75 
 
 		 120 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 172 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  29 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  30.08 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5253  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 247 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.985232  normal  0.973954 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  32.22 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  29.09 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.76 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 126 aa  40.8  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  25.74 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>