27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0400 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0400  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  269  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  43.24 
 
 
120 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  43.24 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  43.24 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  43.24 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  43.24 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  43.24 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  43.24 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  43.24 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  43.24 
 
 
120 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  43.24 
 
 
120 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  41.28 
 
 
116 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  41.28 
 
 
116 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  41.28 
 
 
116 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  41.28 
 
 
116 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  43.97 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  40.37 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.55 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  38.96 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.36 
 
 
421 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  30.38 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 
178 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  39.29 
 
 
182 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 
159 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>