54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4399 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  100 
 
 		 116 aa  245  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  245  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  100 
 
 		 116 aa  245  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  99.14 
 
 		 116 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  98.28 
 
 		 116 aa  244  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  58.49 
 
 		 120 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  58.49 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  45.28 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0400  cupin 2 domain-containing protein  41.28 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  35.87 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  39.73 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  31.08 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  34.85 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  37.14 
 
 		 662 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.77 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  26.13 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.2 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  30 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 171 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  30.23 
 
 		 497 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  30 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.72 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  30 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  30 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 118 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.51 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 154 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>