79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3746 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  257  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  50 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  50 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  50 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  50 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  49.09 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  49.09 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  49.09 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  49.09 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  45.28 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  45.28 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  45.28 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  45.28 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  45.28 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  48.18 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0400  cupin 2 domain-containing protein  43.97 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  31.25 
 
 		 497 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  35.53 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  31.48 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1340  N-acetylneuraminate synthase  36.07 
 
 		 521 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00426215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 192 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  33.78 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  28.57 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  28.71 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  32.61 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  37.5 
 
 		 370 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  31.82 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 125 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  29.07 
 
 		 147 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 377 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  34.69 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 370 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  37.88 
 
 		 332 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  43.75 
 
 		 348 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  32.26 
 
 		 152 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3399  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1759  hypothetical protein  27.85 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  37.1 
 
 		 345 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 197 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.79 
 
 		 255 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  45.65 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  37.5 
 
 		 349 aa  40  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  43.75 
 
 		 364 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 154 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>