100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0633 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.81 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.43 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  37.68 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  39.55 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  39.55 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  39.55 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.67 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  39.32 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  30.67 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.91 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.68 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  32.48 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  34.51 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.36 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.94 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  38.2 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  30.43 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  30.15 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.78 
 
 		 332 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 377 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.81 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  32.63 
 
 		 338 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  37.84 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  37.1 
 
 		 114 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  23.48 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 333 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10448  hypothetical protein  26.04 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3232  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  30.53 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  28.1 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  36.9 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.93 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.3 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.05 
 
 		 389 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  30.95 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  40.85 
 
 		 332 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  40 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  35.48 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  35.48 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  35.48 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  35.48 
 
 		 116 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  35.48 
 
 		 116 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.36 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.25 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  34.38 
 
 		 129 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.81 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.9 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  28.23 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  46.51 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 191 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  46.51 
 
 		 100 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 119 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 195 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  45.45 
 
 		 279 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.36 
 
 		 191 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 118 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.1 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  33.71 
 
 		 279 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.28 
 
 		 169 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  34.52 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0495  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.38 
 
 		 460 aa  40.8  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 117 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 356 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.72 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  44.19 
 
 		 278 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  40.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>