36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5098 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 124 aa  243  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.23 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2240  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.71 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130311  normal  0.0267337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.93 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4632  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.02 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0666075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.64 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  34.55 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  35.05 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  39.36 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  39.66 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  43.75 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  31.68 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  36.71 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  34.92 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 343 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 115 aa  42  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  34.33 
 
 		 147 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  34.21 
 
 		 177 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.07 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 136 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 126 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 121 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>