37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0912 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 125 aa  257  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  81.6 
 
 		 125 aa  214  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.49 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.45 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  37.31 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  29.21 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  29.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2985  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171008  normal  0.0376623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  27.71 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  36.49 
 
 		 122 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 		 153 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 124 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 372 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.38 
 
 		 364 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  33.96 
 
 		 124 aa  40.8  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  33.33 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  29.76 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  29.76 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  29.76 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  29.76 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  30.67 
 
 		 120 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>