91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2286 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 364 aa  744    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.06 
 
 		 374 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.54 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  48.88 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.99 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  41.37 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  42.6 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  42.6 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  42.6 
 
 		 345 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  42.6 
 
 		 345 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  42.6 
 
 		 345 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  43.5 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  43.2 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  41.72 
 
 		 353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  42.53 
 
 		 376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  41.55 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  41.09 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  41.12 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  41.47 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  41.47 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  40.98 
 
 		 348 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  38.48 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  42.94 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  40.11 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  41.87 
 
 		 370 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  41.07 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  40.63 
 
 		 362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  42.24 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  39.71 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  38.92 
 
 		 379 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  39.17 
 
 		 364 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  40.84 
 
 		 347 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  41.14 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.8 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  40.76 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  40.6 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  40.9 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  40.9 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  38.9 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  36.97 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  38.9 
 
 		 361 aa  236  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  39.24 
 
 		 361 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  39.24 
 
 		 361 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  39.24 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  36.21 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  37.04 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  34.8 
 
 		 344 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.13 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  34.96 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  35.34 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  34.93 
 
 		 349 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  35.22 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  34.73 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 255 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  38.03 
 
 		 283 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  35.54 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  33.53 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  33.24 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  32.36 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  32.73 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  30.7 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 181 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  40.48 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  32.93 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  25.86 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  20.99 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  27.45 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  29.21 
 
 		 148 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 136 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 128 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  34.88 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.47 
 
 		 140 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  32.95 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 137 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  27.61 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  31.82 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  37.84 
 
 		 186 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 153 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2143  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 278 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1947  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>