31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3105 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
125 aa  258  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  81.6 
 
 
125 aa  214  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.49 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.78 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  31.46 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  28.09 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.66 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.87 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  37.31 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.59 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 
137 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 
119 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.12 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5851  hypothetical protein  29.59 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  29.47 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  29.47 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  29.47 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  29.47 
 
 
120 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  32.73 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  31.82 
 
 
133 aa  40  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  29.41 
 
 
171 aa  40  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  29.47 
 
 
120 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  34.43 
 
 
122 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>