14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5851 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5851  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  237  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1908  cupin 2, barrel-containing protein  91.15 
 
 		 116 aa  217  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0361  cupin 2, barrel  65.18 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4743  cupin 2 domain-containing protein  55.05 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0126  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.44 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705886  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5057  cupin 2 domain-containing protein  46.43 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.031805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1778  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0617369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2323  cupin 2, barrel  41.96 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000090808  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11732  hypothetical protein  44.87 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0442429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.96 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>