11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1778 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1778  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  246  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0617369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0126  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.17 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.705886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1908  cupin 2, barrel-containing protein  48.15 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4743  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0361  cupin 2, barrel  47.22 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5851  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2323  cupin 2, barrel  40.74 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000090808  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5057  cupin 2 domain-containing protein  41.28 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.031805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11732  hypothetical protein  35.71 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0442429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5176  hypothetical protein  28.24 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>