20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5176 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5176  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.05 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3738  cupin 2 domain-containing protein  21.33 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  29.58 
 
 		 311 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  29.58 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  36.67 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.41 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  29.35 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  28.17 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  36.67 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  36.67 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  35 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  35 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  26.97 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  31.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  31.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  31.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  31.67 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  31.67 
 
 		 278 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>