68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0555 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  80.29 
 
 		 279 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  78.85 
 
 		 279 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  79.21 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  77.78 
 
 		 279 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  72.79 
 
 		 276 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  70.52 
 
 		 282 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0205  hypothetical protein  70.9 
 
 		 278 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  69.6 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  70.15 
 
 		 280 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  69.85 
 
 		 273 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  68.75 
 
 		 278 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  68.75 
 
 		 278 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  68.38 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0448  hypothetical protein  68.5 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  68.38 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  68.38 
 
 		 278 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  68.38 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1553  hypothetical protein  70.9 
 
 		 278 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  69.89 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  69.89 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  68.5 
 
 		 278 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  68.38 
 
 		 278 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  67.65 
 
 		 278 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  67.79 
 
 		 272 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  68.01 
 
 		 278 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  70.15 
 
 		 278 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2601  hypothetical protein  68.75 
 
 		 277 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119813  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  66.67 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0241  hypothetical protein  65.09 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  66.55 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  65.81 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  65.81 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  64.91 
 
 		 278 aa  374  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  68.42 
 
 		 289 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  65.07 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  65.3 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3794  hypothetical protein  64.18 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332323  normal  0.0189653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  63.6 
 
 		 278 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  64.34 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  63.6 
 
 		 311 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  63.6 
 
 		 278 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  61.8 
 
 		 270 aa  338  5e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3435  hypothetical protein  61.76 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2030  allantoin catabolism protein  59.56 
 
 		 271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  58.46 
 
 		 271 aa  321  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.74 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  36.99 
 
 		 249 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  33.72 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.8 
 
 		 246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.199171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00465  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3098  allantoin catabolism protein  31.97 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0553  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00470  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3108  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0616  hypothetical protein  31.56 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0560  hypothetical protein  31.56 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0589  hypothetical protein  31.56 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5176  hypothetical protein  29.35 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 		 122 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 124 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>