67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7819 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  577  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0448  hypothetical protein  78.81 
 
 
278 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  78.89 
 
 
272 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  78.89 
 
 
272 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  75.64 
 
 
280 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  73.61 
 
 
282 aa  431  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  73.36 
 
 
278 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  73.99 
 
 
276 aa  431  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  74.63 
 
 
278 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  73.16 
 
 
278 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  74.63 
 
 
278 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  74.63 
 
 
278 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  73.16 
 
 
278 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  74.63 
 
 
278 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  75.28 
 
 
289 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  75 
 
 
278 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  74.63 
 
 
278 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  75 
 
 
278 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2601  hypothetical protein  72.99 
 
 
277 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119813  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  74.26 
 
 
278 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  73.9 
 
 
278 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  72.63 
 
 
280 aa  417  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  71.69 
 
 
276 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  71.48 
 
 
280 aa  408  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  68.75 
 
 
311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  68.75 
 
 
278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  68.75 
 
 
278 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  68.13 
 
 
279 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  68.01 
 
 
278 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  68.03 
 
 
278 aa  395  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  68.01 
 
 
279 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  69.12 
 
 
273 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  68.38 
 
 
279 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0205  hypothetical protein  67.41 
 
 
278 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  68.4 
 
 
272 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  68.52 
 
 
278 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1553  hypothetical protein  67.41 
 
 
278 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0241  hypothetical protein  64.49 
 
 
277 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  65.07 
 
 
274 aa  377  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3794  hypothetical protein  65.31 
 
 
275 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332323  normal  0.0189653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  68.5 
 
 
279 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  65.07 
 
 
279 aa  367  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  62.92 
 
 
270 aa  355  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2030  allantoin catabolism protein  60.66 
 
 
271 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3435  hypothetical protein  61.05 
 
 
271 aa  345  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  57.35 
 
 
271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.86 
 
 
284 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  34.38 
 
 
268 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.32 
 
 
246 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  34.5 
 
 
249 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.2 
 
 
253 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.199171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.44 
 
 
261 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  30.28 
 
 
248 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00465  hypothetical protein  31.18 
 
 
261 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3098  allantoin catabolism protein  31.18 
 
 
261 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00470  hypothetical protein  31.18 
 
 
261 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0560  hypothetical protein  31.18 
 
 
261 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3108  hypothetical protein  31.18 
 
 
261 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0553  hypothetical protein  31.18 
 
 
261 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0616  hypothetical protein  31.18 
 
 
261 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  30.83 
 
 
261 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0589  hypothetical protein  30.8 
 
 
261 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  30.83 
 
 
261 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  30.83 
 
 
261 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  30.83 
 
 
261 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5176  hypothetical protein  36.67 
 
 
253 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.94 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>