67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3530 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  98.92 
 
 		 278 aa  577  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  95.68 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  78.18 
 
 		 278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  78.18 
 
 		 278 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  76.26 
 
 		 278 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  76.26 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  76.26 
 
 		 278 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  76.26 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  75.9 
 
 		 278 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  75.9 
 
 		 278 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  75.9 
 
 		 278 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  75.9 
 
 		 278 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  75.9 
 
 		 278 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  77.7 
 
 		 280 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  73.23 
 
 		 278 aa  428  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  71.11 
 
 		 280 aa  417  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2601  hypothetical protein  71.16 
 
 		 277 aa  417  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119813  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  70.22 
 
 		 276 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0448  hypothetical protein  71.32 
 
 		 278 aa  414  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  70.07 
 
 		 278 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  69.85 
 
 		 276 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  70.26 
 
 		 289 aa  411  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  69.74 
 
 		 282 aa  411  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  70.37 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  70.37 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0241  hypothetical protein  67.77 
 
 		 277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  68.75 
 
 		 278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  65.79 
 
 		 280 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  65.2 
 
 		 279 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  65.2 
 
 		 279 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  65.2 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  64.44 
 
 		 272 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  65.2 
 
 		 279 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  63.97 
 
 		 273 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3794  hypothetical protein  63.1 
 
 		 275 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332323  normal  0.0189653 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  62.87 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0205  hypothetical protein  63.43 
 
 		 278 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  63.43 
 
 		 270 aa  364  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1553  hypothetical protein  63.43 
 
 		 278 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  63.06 
 
 		 278 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3435  hypothetical protein  61.94 
 
 		 271 aa  355  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  63.6 
 
 		 279 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  55.64 
 
 		 271 aa  323  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2030  allantoin catabolism protein  53.68 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.199171  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  30.62 
 
 		 268 aa  132  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.37 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  34.21 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.8 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  29.77 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  29.77 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  29.77 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  29.77 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0616  hypothetical protein  29.39 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00465  hypothetical protein  29.01 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3098  allantoin catabolism protein  29.39 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0553  hypothetical protein  29.39 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00470  hypothetical protein  29.01 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3108  hypothetical protein  29.01 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0560  hypothetical protein  29.01 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0589  hypothetical protein  28.63 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  30.95 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5176  hypothetical protein  29.58 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.58 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>