66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2030 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2030  allantoin catabolism protein  100 
 
 		 271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  79.7 
 
 		 271 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  63.06 
 
 		 272 aa  351  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  63.06 
 
 		 272 aa  351  5.9999999999999994e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0448  hypothetical protein  61.11 
 
 		 278 aa  351  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3435  hypothetical protein  61.65 
 
 		 271 aa  349  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  60.66 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  61.19 
 
 		 280 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  58.46 
 
 		 278 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  59.19 
 
 		 278 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  59.19 
 
 		 278 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  58.61 
 
 		 278 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  59.04 
 
 		 272 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  58.61 
 
 		 278 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  58.46 
 
 		 278 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  58.61 
 
 		 278 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  59.19 
 
 		 273 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  58.89 
 
 		 282 aa  343  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  58.46 
 
 		 278 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  58.82 
 
 		 278 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  59.04 
 
 		 278 aa  342  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  58.46 
 
 		 276 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  60.44 
 
 		 276 aa  339  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  58.65 
 
 		 270 aa  339  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  59.19 
 
 		 279 aa  338  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  58.43 
 
 		 289 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0205  hypothetical protein  59.33 
 
 		 278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  58.82 
 
 		 279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  59.77 
 
 		 280 aa  334  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  57.3 
 
 		 278 aa  329  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2601  hypothetical protein  57.25 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119813  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1553  hypothetical protein  59.33 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  56.62 
 
 		 274 aa  328  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3794  hypothetical protein  60.38 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332323  normal  0.0189653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  55.68 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  55.68 
 
 		 278 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  57.46 
 
 		 280 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  59.33 
 
 		 278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0241  hypothetical protein  56.72 
 
 		 277 aa  325  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  56.99 
 
 		 279 aa  323  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  53.68 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  53.68 
 
 		 311 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  53.31 
 
 		 278 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  53.68 
 
 		 278 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  55.88 
 
 		 279 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  59.56 
 
 		 279 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.13 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  35.27 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.199171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00465  hypothetical protein  34.73 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00470  hypothetical protein  34.73 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3108  hypothetical protein  34.73 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0560  hypothetical protein  34.35 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3098  allantoin catabolism protein  34.35 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0553  hypothetical protein  34.35 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0589  hypothetical protein  34.35 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0616  hypothetical protein  34.35 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.39 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  37.12 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  35.48 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.95 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>