69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5329 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  99.28 
 
 		 278 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  98.56 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  98.56 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  98.56 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  97.48 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  97.84 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  96.04 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  96.4 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  84 
 
 		 278 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  84 
 
 		 278 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  80.73 
 
 		 280 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  76.62 
 
 		 278 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  76.26 
 
 		 278 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  75.9 
 
 		 311 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  75.9 
 
 		 278 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  77.21 
 
 		 276 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  76.64 
 
 		 278 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  78.73 
 
 		 289 aa  447  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  77.53 
 
 		 280 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0241  hypothetical protein  74.73 
 
 		 277 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2601  hypothetical protein  75.66 
 
 		 277 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119813  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  76.47 
 
 		 276 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0448  hypothetical protein  75.46 
 
 		 278 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  73.61 
 
 		 278 aa  432  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  72.89 
 
 		 282 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  74.26 
 
 		 272 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  74.26 
 
 		 272 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  74.26 
 
 		 278 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  71.43 
 
 		 280 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  68.5 
 
 		 279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  68.5 
 
 		 279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  67.77 
 
 		 279 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  68.38 
 
 		 273 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0205  hypothetical protein  68.03 
 
 		 278 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  69.78 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  66.18 
 
 		 274 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3794  hypothetical protein  68.3 
 
 		 275 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332323  normal  0.0189653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  68.4 
 
 		 278 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1553  hypothetical protein  68.4 
 
 		 278 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  67.4 
 
 		 279 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  67.54 
 
 		 270 aa  381  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  68.75 
 
 		 279 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3435  hypothetical protein  65.3 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2030  allantoin catabolism protein  58.46 
 
 		 271 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  58.46 
 
 		 271 aa  339  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.09 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.199171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.43 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  31.78 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  37.83 
 
 		 249 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  31.64 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  31.64 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  31.64 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  31.64 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0616  hypothetical protein  29.62 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0560  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3098  allantoin catabolism protein  29.62 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0553  hypothetical protein  29.62 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00470  hypothetical protein  29.62 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00465  hypothetical protein  29.62 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3108  hypothetical protein  29.62 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0589  hypothetical protein  29.23 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  29.72 
 
 		 248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  24.22 
 
 		 155 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  33.87 
 
 		 121 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>