50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6135 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  39.8 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.89 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.79 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  47.27 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.45 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 311 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  24.22 
 
 		 278 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  24.22 
 
 		 278 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  35.42 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  35.38 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  24.19 
 
 		 278 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  38.71 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  29.67 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3738  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.09 
 
 		 133 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2331  hypothetical protein  34.43 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.143705  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 128 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.23 
 
 		 467 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  38.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 114 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6124  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 372 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>