45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2869 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  62.5 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1738  cupin 2, barrel  64.65 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.39391  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  55.86 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  52.94 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  51.14 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  34.55 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  36.54 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  38.64 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.47 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.47 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0969  hypothetical protein  28.43 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.307514  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  23.33 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.17 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  35.38 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.25 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1597  hypothetical protein  28.05 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  30.67 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 199 aa  41.6  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  31.43 
 
 		 155 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  25.3 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  27.85 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.36 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.6 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.76 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  22.22 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0884  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  27.87 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  26.42 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.6 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  26.67 
 
 		 112 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  21.18 
 
 		 106 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>