33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1033 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  225  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  55.14 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  55.56 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1252  hypothetical protein  48.11 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00699027  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0852  hypothetical protein  47.17 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0782  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  46.88 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  36.62 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  28.24 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  29.89 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  32.88 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  31.34 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  31.51 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  25.58 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.08 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  30.67 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.27 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  35.29 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.27 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  34.29 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  24.74 
 
 		 111 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 110 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 112 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.79 
 
 		 131 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  26.21 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  27.42 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  22.78 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  26.67 
 
 		 112 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>