35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1304 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  61.47 
 
 		 110 aa  130  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.63 
 
 		 110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  48.6 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  50.93 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  45.79 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  43.93 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  47.22 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.93 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  41.12 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  42.99 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  42.06 
 
 		 109 aa  87  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  38.89 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  39.25 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  39.25 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.38 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  34.58 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  34.78 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1179  hypothetical protein  23.33 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  43.08 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0857  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.17 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  34.92 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  40.91 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  27.63 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  31.03 
 
 		 117 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  28.99 
 
 		 112 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.54 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3944  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0892017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  27.69 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 115 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>